２０１１年の鷹月地震の後遺症で、この世の万物に宿る『波動』が視える ようになった少年、冬芽忍武は７年後に訪れた母の墓参り先で、ラジエイ ターという能力者の少女、榊美保と出会う。彼女から地震の元凶を知った 忍武は共に、地震エネルギーが具現化した怪物『波動ナマズ』と戦う決意 をするのだった。